R 言語におけるポアソン回帰モデルの適合度検定の実装と注意点
ポアソン回帰における逸脱度検定の仕組み
カウントデータを扱う際の標準的な手法としてポアソン回帰モデルが広く利用されています。多くの統計ソフトウェアでは、モデル適合後に自動的に適合度検定の結果を提供するか、容易に実行できる機能を持っています。しかし、この検定結果を無条件に信頼することは危険であり、その限界を理解しておく必要があります。
モデルの適合 ...
7月18日 23:42 投稿
R言語でのデータ操作基礎
ここではR言語の主要なデータ操作関数について説明します。特に、factor, cut, recode, summary, describe, table, そして levels に焦点を当てます。
ファクター
ファクターはカテゴリカルなデータを表すために使用されます。以下がその基本的な構文です。
factor(x = character(), levels, labels = levels,
exclude = NA, ordered = is.ordered(x), nmax = NA)
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7月10日 19:21 投稿
単細胞解析：条件間の統合分析
目的
このチュートリアルでは、処理群とコントロール群のPBMC（人外周血単核球）データセットを統合し、細胞タイプ特異的な反応と統合の役割を理解することを目的としています。ここでは、Seuratを使用して複雑な細胞タイプの比較分析を行う方法を紹介します。
目標
両データセットに存在する細胞タイプの識別
コントロール群と処理群で共通する細胞タイプマーカーの取 ...
7月3日 16:06 投稿
データ変形のためのmeltとdcast関数
データ変形のためのmeltとdcast関数
data.tableパッケージは主にデータの変形操作に使用されます。その中でも主要な関数としてmeltとdcastがあります。ここでmeltは主に広い形式から長い形式への変換に使用され、dcastは長い形式から広い形式への変換に使用されます。
meltとdcastは元々reshape2パッケージに含まれていましたが、現在はdata.tableパッケージに拡張として ...
6月28日 17:50 投稿
caretパッケージを用いたR言語での機械学習：前処理からモデル評価までの体系的アプローチ
Rにおけるcaretパッケージの役割と基本構造
R言語は統計解析および機械学習タスクにおいて広く利用されており、caret（Classification And Regression Training）パッケージはその中核をなすツールの一つです。このパッケージは多様な機械学習アルゴリズムに対して一貫したインターフェースを提供することで、モデルの実装コストを大幅に削減します。
200以上の学習ア ...
6月7日 17:03 投稿