R言語で高品質なボックスプロットを作成し、学術論文の質を向上させる方法
高度なボックスプロットの描画
以下のボックスプロットは視覚的に美しく、データ量が多くなく、分布が明確な場合に特に適しています。
論文作成において、図表の明快さと魅力的な表示方法は非常に重要です。ボックスプロット(箱ひげ図)はデータの分布を示す古典的なツールであり、データの中心傾向、散らばり、および外れ値を明確に示すだけでなく、これらの情報を視覚 ...
8月16日 02:13 投稿
Rプログラミング入門:基礎から実践まで
はじめに
2024年1月15日
最近、いくつかの友人からR言語について尋ねられ、puqでは社会科学や自然科学の分野でR言語の学習が共有されているのを見かけました。
これはかなり人気があり実用的なツールだろうと思い、冬休みを利用してR言語を独学することに決め、学習ノートをブログ形式で記録することにしました。
2月12日
他のことが忙しくて、この目標を思い出したのは今 ...
7月27日 17:11 投稿
R言語におけるリストの基本概念
はじめに
リストはインデックス付きのオブジェクト群であり、異なるデータ型を含むことができる。その強みと有用性は汎用性にあります。Rでは、複雑な関数の出力を収集・保存するためによく使われます。データフレームはリストの特殊な形です。
リストはlist(...)関数を使って作成され、カンマで区切られた引数を受け取ります。サブリストを選択するには単一角括弧を使用し ...
7月22日 03:43 投稿
WGCNA解析による遺伝子共発ネットワークの構築
データの読み込みとクラスタリング
library(WGCNA)
# ディレクトリ名の確認
dir()
# データの読み込み
load('DEG_TB_LTBI_step13.Rdata')
# 行がサンプル名、列が遺伝子名
################################ サンプルクラスタリング ####################
datExpr = t(dataset_TB_LTBI_DEG)
# 初期クラスタリング
sampleTree = hclust(dist(datExpr), method = "av ...
6月4日 22:01 投稿
R言語による自然言語処理:テキスト分類の実装
本記事では、R言語を使用した自然言語処理の実践的な手法として、TF-IDFと類似度行列を用いた文書分類について解説します。この手法は、任意のテキストが既存のどの文書カテゴリに最も類似しているかを判断するために使用できます。
1. データ準備
まず、分析対象のデータを読み込みます。ここではCSVファイルからデータをインポートし、必要な前処理を行います。
libr ...
5月21日 02:23 投稿
TF-IDFを使ったR言語でのキーワード抽出
自然言語処理において、文書から重要な情報を効率的に抽出する技術は非常に重要です。この記事では、R言語を使用してテキストデータからキーワードを自動的に抽出する方法について説明します。特に、TF-IDF(Term Frequency-Inverse Document Frequency)というアルゴリズムに焦点を当て、その実装例を紹介します。
TF-IDFの基本概念
TF-IDFは、単語の重要度を評価するため ...
5月19日 22:02 投稿